COVID-19 精选文献

https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1009165

Mor, M. et al. Multi-clonal SARS-CoV-2 neutralization by antibodies isolated from severe COVID-19 convalescent donors. PLoS Pathog 17(2): e1009165. 2021.

SARS-CoV-2 抗体、免疫细胞与疾病严重程度之间的关系尚不明确。本研究分析了重症和轻症 SARS-CoV-2 献血者恢复期血液中抗体应答的细胞、分子和功能特征。当使用分离得到的抗 SARS-CoV-2 抗体时，作者通过 Incucyte^® S3 活细胞分析系统监测了细胞死亡和细胞间融合。数据表明，重症 COVID-19 触发独特的抗体应答，可以为抗体鸡尾酒疗法提供信息。

主要发现：

• 重症献血者抗 SARS-CoV-2 IgG 相对于刺突蛋白受体结合域 (RBD) 的滴度更高，并且 B 细胞扩增更高。
• 在活细胞分析中，分离得到的 22 个单克隆抗体中有 6 个有效地中和了活病毒并阻止了合胞体的形成。肽库、计算方法和突变分析一同揭示了抗体结合的机制。
• 分离的中和抗体鸡尾酒疗法阻止了细胞培养中病毒的复制。

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.17.156455v1.abstract

Stukalov, A. et at. Multi-level proteomics reveals host-perturbation strategies of SARS-CoV-2 and SARS-CoV, 2020. doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.17.156455

开发针对 SARS-CoV2 的治疗方法需要更好地了解病毒蛋白与宿主蛋白之间的相互作用。这项蛋白质组学研究表征了 SARS-CoV-2 及相关冠状病毒感染中涉及的病毒 - 宿主中蛋白质相互作用和信号转导过程。这些数据揭示了可以通过已知药物调控从而改变冠状病毒感染过程的独特和常见的通路。

主要发现：

• 蛋白质组学分析鉴定了 1086 种细胞蛋白与 24 种 SARS-CoV-2 和 27 种 SARS-CoV 引诱蛋白之间的 1484 种相互作用，表明它们涉及一系列生物学过程。
• 综合数据显示，应激和 DNA 损伤反应、转录调节和细胞连接组织等关键途径均参与了感染过程。
• 使用 48 种临床批准的化合物对这些通路进行靶向选择性分析，识别出对 SARS-CoV2 具有显著抗病毒活性的激酶和基质金属蛋白酶抑制剂。作者使用了 Incucyte^® S3 活细胞分析系统进行延时荧光病毒检测。

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33514825/

Dogan, M. et al. SARS-CoV-2 specific antibody and neutralization assays reveal the wide range of the humoral immune response to virus. Commun Biol. 4(1):129. 2021.

了解 COVID-19 抗体响应的数量、质量和持续时间对疫苗的开发至关重要。本研究通过开发高度敏感和特异性的 SARS-CoV-2 抗体及抗体中和检测方法，填补了该领域中的一个重大空白。在 iQue^® 高通量流式细胞仪上进行 SARS-CoV-2 蛋白抗体结合筛查。作者用该试验证明了 COVID-19 患者的多种体液免疫应答。

主要发现：

• 基于微球的荧光免疫法能够在稀释 10 万倍的 SARS-CoV-2 受试者血浆样本中准确检测出 SARS-CoV-2 刺突蛋白或核衣壳蛋白特异性 IgG 抗体。该方法还可检测到其他抗体亚型。
• 使用了 SARS-CoV-2 刺突蛋白假病毒的稳定检测方法在稀释倍数高达 10000 倍的 COVID-19 和恢复期血浆中均检测到了中和作用。
• 检测显示了 COVID-19 患者体液免疫应答的差异；具体来说，重症患者的抗体和中和滴度是门诊或康复期血浆捐献者的 3000 倍。

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283620306732

Hattori, T. et al. The ACE2-binding Interface of SARS-CoV-2 Spike Inherently Deflects Immune Recognition. J Mol Biol. 433(3):166748. 2021.

详细了解 SARS-CoV-2 刺突蛋白及其受体结合域 (RBD) 的免疫原性表面对于开发有效疫苗和基于抗体的治疗手段至关重要。本研究利用 RBD 突变体作为表征 COVID-19 患者恢复期血清中抗 RBD 抗体的工具。数据显示，RBD 的 ACE2 相互作用表面的免疫原性低于其他区域。作者使用先进的高通量流式细胞术 iQue^® 系统进行了基于细胞和微珠的结合检测。

主要发现：

• 对恢复期血清中抗体的结合分析表明，大多数抗体并不靶向 RBD 的 ACE2 相互作用表面。
• 使用人抗体噬菌体展示文库进行的无偏向性体外抗体选择显示，89% 的克隆体结合了刺突蛋白，但没有结合 RBD 或 ACE2 结合表面。通过偏向性筛选识别出了靶向 ACE2 结合表面的抗体。
• 在无偏向性选择中结合 RBD 的抗体则优先结合未暴露于天然棘突蛋白三聚体的表面。