新冠研究
Octet平台上的新冠研究
在赛多利斯,我们决心支持研究人员在全球范围内寻找SARS-Cov2病毒急需的治疗方法和疫苗。作为我们承诺的一部分,我们已编译了链接和资源,以获取更多信息。您可以在“资源”选项中找到有关最新出版物中如何使用我们的Octet系统用于新冠研究的介绍。自2020年1月首次共享COVID-19序列以来,Octet系统数据已在与冠状病毒生物学,疫苗和抗病毒治疗发展有关的几篇突破性出版物中得到了体现。
Octet新冠研究
下表提供了一些重要的研究文章,其中Octet系统在阐明COVID-19病毒颗粒的结合动力学和亲和力、中和作用、交叉阻断作用或效价方面发挥了作用。当有新信息可用时,我们将更新此表和此页面上的其他信息以提供最新信息。
分析物 |
偶联配体 |
病毒种属 |
分析焦点 |
生物传感器 |
参考文献 |
---|---|---|---|---|---|
ACE2 |
Fc-tagged SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
交叉反应和受体结合 |
AHC |
|
ACE2 |
SARS-CoV-2 SB SARS-CoV SB |
SARS CoV-2 |
受体结合 |
HIS1K |
|
mAb, MERS S protein, VHH |
SARS CoV-2 S1, SARS CoV-2 RBD |
SARS CoV-2 |
VHH和mAb结合评估,抗原表位分组 |
AR2G |
|
Fab, IgG |
SARS CoV-2 S protein, SARS CoV-2 RBS |
SARS CoV-2 |
FAB,IgG结合表征 |
HIS1K |
|
ACE2, SARS-CoV RBD |
SARS-CoV特异性中和抗体 |
SARS CoV-2 |
交叉反应结合 |
SA |
|
抗体 |
生物素化重组SARS-CoV S1蛋白 |
SARS CoV-2 |
中和抗体评估 |
SA |
|
FAB, ACE2, SARS S protein |
mAb, ACE2 |
SARS CoV-2 |
受体结合,抗体活性,竞争分析 |
AHC, HIS1K |
|
SARS CoV-2 RBD |
抑制剂多肽 |
SARS CoV-2 |
多肽抑制剂开发 |
SA |
|
mAb |
S1B and SARS Secto domains |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
抗体活性评估 |
HIS1K |
|
SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD, mAbs, FAB |
mAbs, SARS CoV-2 RBD, SARS CoV RBD |
SARS CoV and SARS CoV-2 |
抗体结合表征,表位分组,竞争结合 |
Protein A, HIS2, HIS1K |
|
新冠病毒S蛋白 |
Biotin-9OAc6SLN |
SARS CoV and MERS CoV |
受体结合 |
SA |
|
MERS-5HB fusion inhibitor |
生物素化多肽(MERS-HR2P) |
MERS CoV |
蛋白质抑制剂开发 |
SA |
|
mAb, MERS S protein |
mAb, MERS S protein |
MERS CoV |
抗原表位分组和受体结合 |
SAX, Protein A |
|
MERS-CoV S |
mAbs |
MERS CoV |
抗体活性测定,竞争分析 |
AHC, HIS1K |
|
MERS-CoV NTD, mutants |
mAb |
MERS CoV |
抗体活性测定 |
AHC |
|
MERS S-protein |
mAbs |
MERS CoV |
抗体活性测定 |
AHC |
|
RBD,S1,S2 domains |
疫苗诱导的小鼠单克隆IgG |
MERS CoV |
抗体活性与表位结合 |
AHC, HIS1K |
|
FABs |
MERS-CoV RBD |
MERS CoV |
抗原表位分组 |
HIS1K |
|
RBD |
ACE2 |
SARS-CoV-2 |
结合亲和力 |
AHQ |
|
多重特异性、多重亲和力的抗体 |
RBD |
SARS-CoV-2 |
结合亲和力 |
NTA |
|
ACE2 |
RBD |
SARS-CoV-2 |
抗体结合表征,表位鉴定分析,竞争结合实验 |
Protein A |
|
r-spike ecto protein, IgGs |
mAb, Spike ectodomain protein |
SARS-CoV-2 |
抗体结合表征,表位鉴定分析,竞争结合实验 |
AMC, SA |
|
IgGs |
RBD |
SARS-CoV-2 |
表位鉴定分析 |
AHC |
|
ACE2-PD, B38 Ab |
P2 S |
SARS-CoV-2 |
BNT162b2(mRNA疫苗)表达产物与受体及中和抗体的亲和力 |
SA, Protein G |
Octet-BLI平台为协助科学家加速新冠研究,可提供:
- 高通量动力学相互作用分析解决方案,快速选择抗原靶点、疫苗和治疗候选方案
- 用于抗体表位鉴定和覆盖度测定的快速灵活平台
- 为疫苗和生物治疗开发研究量身定制的高效工作流程并配有广泛的生物传感器
- 上游和下游疫苗开发和生产的通用解决方案,如疫苗效力、稳定性和效价测量
- 直观易用的数据分析软件工具
结合动力学表征
据报告,上海复旦大学的Ying等人与武汉病毒研究所的其他人员合作,评估抗冠状病毒抗体与新型冠状病毒刺突蛋白的交叉反应,因为新型冠状病毒和冠状病毒中受体结合结构域(RBD)具有高度一致性。他们首次报告中使用Octet系统获得的数据,冠状病毒特异性人单克隆抗体CR3022可与新型冠状病毒RBD(KD为6.3nM)有效结合。此类结果对最终开发有效的抗病毒治疗剂和疫苗至关重要。
Joyce等人使用新型冠状病毒S RBD的高分辨率晶体结构报告了类似的观察结果。使用Octet系统检测已知与冠状病毒和MERS冠状病毒RBD相互作用的抗体和新型冠状病毒结合活性。只有两种抗体240CD和CR3022对新型冠状病毒RBD的低nM结合亲和力。
复旦大学的Ying等人发表过另一篇文章,描述靶向新型冠状病毒RBD的单域抗体的产生和检测。使用新型冠状病毒RBD和S1作为抗原进行淘选,鉴定出靶向RBD新型冠状病毒上五种类型中和或非中和表位的抗体。选择其中18例,以供进一步研究。应用生物层干涉技术(BLI)和ELISA测定,发现其与新型冠状病毒RBD有效且特异性结合,其中亲和力为亚nM级至nM级。
在关于靶向新型冠状病毒RBD的单域抗体的文章中,Ying等人在使用Octet系统的竞争结合测定中检测18种人单域抗体,并发现可将其分成三个竞争组(A组、B组或C组)-彼此无任何竞争表现。
Octet平台技术正在帮助世界各地的科学家了解更多有关新冠肺炎疫情的信息。在本资料中,我们重点介绍许多病例中的两个。作为开发疫苗的第一步,研究人员正在使用Octet系统来了解病毒结合机制。
在生产过程中快速、准确地测定疫苗滴度对了解疫苗开发流程性能以及正确调整每个流程步骤很重要。Octet平台凭借96孔或384孔板格式的高通量特性,提高了精确度和重现性,是一种更简单、更直接的疫苗/抗原-抗体结合测量方法。他们为流程开发组提供一个强大且易于使用的SRID替代方法。对于96孔板样本,Octet平台将测定时间从数天缩短至几小时。
过去几个月的研究强调,新型冠状病毒的S1蛋白是主要治疗靶点。适配体团队成功分离出一种可选择性结合新型冠状病毒刺突S1蛋白的单克隆适配体。他们使用Octet Red384系统检测抗新型冠状病毒及相关病毒的适配体,也鉴定在不同位点结合蛋白的适配体。
全球新冠研究
由世界卫生组织(WHO)收集并每日更新的关于新冠的全球研究。世卫组织新冠文献 - 世卫组织新冠文献
艾伦人工智能研究所与领先的研究小组合作,准备和分发新冠开放式研究数据集(CORD-19)。有超过52,000篇学术文章的免费资源,包括41,000多篇关于新冠和冠状病毒家族的文章,供全球研究界使用。在线的全文搜索数据库可以通过以下链接访问。还可以在病毒研究中进行搜索引用Octet产品使用的出版物。 - 人工智能数据库
一份为研究人员、非营利组织和商业组织,特别是针对新冠和冠状病毒相关研究的开放式资助电话和其他支持的精心策划的清单,每天都会进行维护和更新。- 资助监督
美国国立卫生研究院(NIH)列出了所有与冠状病毒相关的资助机会。 - 来自美国国立卫生研究院的资助